PQQ 保護和保持細胞健康的能力，即使在面臨損傷時，也促使人們探索 PQQ 作為創傷性損傷情況下的神經保護化合物。
在創傷性腦損傷的齧齒動物實驗模型中， PQQ 治療成功地阻止了細胞死亡。它通過阻止半胱天冬酶（Caspase）的激活來做到這一點，半胱天冬酶是與導緻細胞死亡的途徑相關的蛋白質。這種保護作用與大腦功能和認知能力的改善有關，否則在頭部受傷後會顯著降低。
這些神經保護作用還延伸到連接大腦、脊髓與四肢和器官的周圍神經系統。 PQQ 治療可促進已切斷的周圍神經的再生。這一重要發現導緻了填充 PQQ 的神經修複導管的發展。目的是讓外科醫生在神經重建手術中使用這些，以幫助最大限度地在神經損傷後恢複。
對于跌倒風險較高的成年個體來說，頭部外傷是一個主要問題。如果頭部受傷， PQQ 可以防止過度損壞。
PQQ 和中風
中風仍然是導緻癱瘓、記憶力減退、養老院護理和過早死亡的主要原因。急救醫學技術，如血凝溶解藥物治療（組織纖溶酶原激活劑或tPA）正使許多中風患者免于永久性癱瘓。
更先進的方法，例如血管内血栓切除術（從閉塞的大腦動脈中機械取出凝塊），使更多的中風患者能夠避免癱瘓。血栓切除術在缺血性中風症狀出現後24小時内被證明有效。
PQQ 可以進一步保護大腦免受中風的破壞作用。在實驗室研究中， PQQ 減少了缺血性損傷，有可能改善中風後的生活質量。這在缺血性中風的動物模型中得到證實。當在誘導缺血之前補充 PQQ 時，它顯著減小了受損腦組織區域的大小。令人驚訝的是，即使在誘導缺血後給藥 PQQ 也具有類似的保護作用。
另一項研究顯示了類似的神經保護作用。它還表明， PQQ 可顯着改善中風後的神經行為評分。這些發現對于人類中風預防和治療領域的工作人員來說非常令人興奮。這意味着中風患者可以在急診室接受 PQQ 治療，以減少癱瘓性腦損傷。