大腦是體内代謝最活躍的器官之一。由于 PQQ 具有刺激線粒體生長的能力，研究人員認為它應該對認知和大腦健康産生有益影響。線粒體生物發生已被确定為防止神經變性和認知能力下降的關鍵。
根據《Adv Exp MedBiol.》（實驗醫學與生物學進展雜志）2016.08.報道的一項研究，41名健康的老年受試者被随機分配接受每天20mg的 PQQ ，持續12周或安慰劑。與安慰劑相比，補充 PQQ 與注意力和工作記憶的顯著改善以及額葉腦血流量的增加相關。對于健忘的老年人（自我識别或由家人或熟人識别），相同的 PQQ 劑量導緻8周後記憶測試分數的提高。
研究人員還發現證據表明 PQQ 可能會減緩嚴重神經退行性疾病的進展，包括阿爾茨海默症和帕金森症，甚至完全預防它們。這是因為，除了增強線粒體功能外， PQQ 還被發現可以防止異常蛋白的積累。與這些疾病相關的蛋白質（如β-澱粉樣蛋白和α-突觸核蛋白）。
此外， PQQ 可防止這些異常蛋白質損害大腦功能的毒性作用。例如，暴露于澱粉樣蛋白的細胞通常會表現出氧化應激和細胞死亡。在一項研究中， PQQ 治療顯著逆轉了這些影響，有助于保持腦細胞的活力和健康。這表明 PQQ 具有阻止各種癡呆症發展的巨大潛力。